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Bei einem Systemaudit wird geprüft, ob die Validierung korrekt durchgeführt und dokumentiert wurde und ob der Systembetrieb so geschieht, dass Sie das System unter Kontrolle haben. Damit verbunden ist die Prüfung der internen Vorgaben zur Validierung (QMS für die IT).

Das Ziel ist nicht nur, die formelle Korrektheit zu prüfen. Vielmehr geht es auch um Hinweise und konkrete Vorschläge, um den Aufwand künftiger Validierungsaktivitäten zu reduzieren. Über die Validierung hinaus lohnt es sich, dabei auch das Projektmanagement anzusehen und auch hier Verbesserungspotential zu identifizieren.

Bei einem Firmenaudit geht es meist um die Qualität eines Software-Lieferanten oder Service-Partners, der ein IT-System konfigurieren und implementieren möchte. Durch die Erkenntnisse aus dem Anbieteraudit ist es möglich, die Validierungsstrategie an die Qualität des Lieferanten anzupassen.